古代の DNA 再

Scientific Reports volume 13、記事番号: 13635 (2023) この記事を引用

2696 アクセス

18 オルトメトリック

メトリクスの詳細

古ゲノミクスは、絶滅種の系統学を含むいくつかの分野に関連する影響を及ぼし、前例のない解像度で多くの主要な進化事象の理解を洗練させることに貢献しています。 これまでのところ、地中海地域の現存および絶滅した動物種は、DNA レベルでほとんど解明されていません。 サルデーニャナキウサギ、Prolagus sardus (Wagner、1829 年) は、サルデーニャ島とコルシカ島に生息していた象徴的なウサギ目類で、完新世に絶滅しました。 絶滅した Prolagus 属が、Ochotonidae 科 (ウサギ目で現存する 2 科のうちの 1 つ) か、分離した Prolagidae 科、または Ochotonidae 科内の Prolaginae 亜科に系統学的に割り当てられるかについては、科学的な議論があります。 この研究では、サルデーニャの遺跡であるカバダリス洞窟から回収された、新石器時代のサルデーニャナキウサギのミトゲノムの一部を再構成することに成功しました。 私たちの校正された系統発生は、Prolagus 属が約 3,000 万年前に Ochotona 属の系統から分岐した Ochotonidae 科の独立した姉妹グループであるという仮説を裏付ける可能性があります。 これらの結果は、古生物学的研究によってすでに記載されているプロラガス属の形態学的特徴の系統学的解釈を改良することに貢献する可能性がある。

絶滅した動物種の古代 DNA (aDNA) に関する研究により、過去を掘り下げ、古典的な古生物学的アプローチを補完して、前例のないレベルで進化の軌跡を再構築することが可能になりました 1,2,3,4,5,6。 特に、ミトコンドリア DNA (mtDNA) は、核ゲノムに関して古代遺跡に豊富に存在し、高い突然変異率とほぼ中立的な進化様式を示すため、系統発生と個体群動態を理解するための有用なツールとなります 7、8、9、10、11。 12.

これまでに地中海地域のいくつかの絶滅した動物種が DNA レベルで特徴付けられており、隔離された固有種の独自の進化の歴史に関する情報が提供されています 3,4,7,13,14,15,16。 興味深い事例研究は、サルデーニャ島の 1 つの絶滅種に基づいています。 謎の絶滅したサルデーニャのドール、Cynotherium sardous Studiati (1857 年) に関連する古ゲノムデータは、後期更新世の終わりまでこの島に生息していたこのユニークなイヌ科動物種が、他のすべての現生イヌ科動物とは別の分類群であり、他のイヌ科動物から遺伝的に隔離されたことを示しました。本土のイヌ科動物の系統は約 500 ～ 300 kya (中期更新世)4.

サルデーニャ島とコルシカ島に生息していたもう 1 つの謎めいた象徴的な絶滅種は、サルデーニャナキウサギ Prolagus sardus (Wagner、1829)17、18、19 です。 ウサギ目に属する Prolagus Pomel 属 (1853 年) は、新第三紀および第四紀に生息していたいくつかの種によって記録されています 19、20、21。 この属に属する化石は、ヨーロッパ、北アフリカ、アナトリアの多くの場所で確認されています。 Prolagus の進化の歴史と解剖学は、伝統的にこの属を Ochotonidae Thomas 科の特異なメンバーであると考えてきた数人の著者によって議論されてきました。現在、この文献には生きているナキウサギのみが含まれており、すべてオコトナリンク属に分類されています（1795 年）。ただし、他の数人の著者は、すべての絶滅したプロラグス種は別の科であるプロラギダエ グレエフ（1964 年）、あるいはオコトナ科の亜科であるプロラギナエに属すると提案しています23。 、24、25、26、27、28。 下第 3 大臼歯 (M3) の欠如は、Prolagus 種を Ochotona 属と区別する主要な解剖学的要素の 1 つです 20,30。 プロラグスは、ヨーロッパの漸新世から下部中新世の分類群である単一特異性ピエゾドゥス ヴィレット属 (1929 年) から栄養学的に派生したと考えられています。プロラグスとは、根のある頬歯とメタフレキシドの存在と、第 3 歯の原円錐突起の欠如が異なります。下小臼歯20、21、31、32。 プロラグス種は、ガルガーノ古列島（中新世後期?鮮新世初期）およびサルデーニャ・コルシカ島ブロック（鮮新世後期～完新世）で採取された分類群によって記録されているように、地中海の島嶼環境に存在することが知られている。 コルシカ島とサルデーニャ島では、Prolagus 属は 3 つの風土病分類群を含む成長系統によって代表されます。 figaro (Capo Mannu D1 の後期鮮新世初期)、Prolagus figaro López-Martínez、1975 (最新鮮新世?/最期更新世 - 前期更新世後期) および Prolagus sardus (Wagner、1829) (中期更新世 - 完新世)17,20,32、 33、34、35、36。